Pokuta za nepodání kontrolního hlášení, pokud povinnost podat vůbec nevznikla

Pokutu související s kontrolním hlášením může uložit správce daně na základě zákonem vymezených pravidel. Za nepodání jednoho kontrolního hlášení hrozí pokuta až 50 000 Kč. Promíjení pokut je sice možné, ale pouze v několika případech, jako je například živelná katastrofa či zdravotní důvody, a navíc je třeba naplnit řadu podmínek.

Pro plátce může být však důležité pravidlo, že pokuta za nepodání kontrolního hlášení v náhradní lhůtě může být udělena, jen pokud na začátku měl plátce povinnost KH vůbec podat. Toto pravidlo bylo projudikováno v rámci rozsudku Nejvyššího správního soudu (dále jen „NSS“) č. j. 7 Afs 317/2024-23 ze dne 13. 5. 2025. Tento článek se zabývá shrnutím pokut ke kontrolnímu hlášení a tímto rozsudkem.

1. Jaké jsou sankce spojené s kontrolním hlášením?

Pokuty za porušení povinností souvisejících s kontrolním hlášením a speciální procesní pravidla jsou stanovena v ustanoveních § 101h až § 101k zákona č. 235/2004 Sb., o dani z přidané hodnoty (dále jen „zákon o DPH“).

Ustanovení § 101h odst. 1 zákona o DPH upravuje situace pro uložení dané pokuty i výši této pokuty. Situace, kdy správce daně ukládá pokutu, jsou, když plátce nepodá kontrolní hlášení ve stanovené lhůtě, a to v těchto částkách:

• § 101h odst. 1 písm. a) zákona o DPH stanovuje pokutu ve výši 1 000 Kč, pokud plátce kontrolní hlášení dodatečně podá, aniž by k tomu byl vyzván,
• § 101h odst. 1 písm. b) zákona o DPH stanovuje pokutu ve výši 10 000 Kč, pokud plátce kontrolní hlášení podá v náhradní lhůtě poté, co k tomu byl správcem daně vyzván,
• § 101h odst. 1 písm. c) zákona o DPH stanovuje pokutu ve výši 30 000 Kč, pokud plátce kontrolní hlášení nepodá na základě výzvy ke změně, doplnění či potvrzení údajů uvedených v podaném kontrolním hlášení, a
• § 101h odst. 1 písm. d) zákona o DPH stanovuje pokutu ve výši 50 000 Kč, pokud plátce kontrolní hlášení nepodá ani v náhradní lhůtě.

Na základě § 101h odst. 2 zákona o DPH platí, že pokuta podle odstavce 1 písm. b) až d) ustanovení § 101h zákona o DPH (tedy pokuty 10 000 Kč, 30 000 Kč a 50 000 Kč) se uloží v poloviční výši, pokud je:

• plátce fyzickou osobou,
• ke dni, ve kterém vznikla povinnost uhradit tuto pokutu, zdaňovacím obdobím plátce kalendářní čtvrtletí, nebo
• plátce společností s ručením omezeným, která má jednoho společníka, přičemž tento společník je fyzickou osobou, přičemž pro účely posouzení splnění těchto podmínek je rozhodným dnem první den kalendářního čtvrtletí, ve kterém vznikla povinnost uhradit tuto pokutu, nebo den vzniku této společnosti, pokud tato skutečnost nastane po rozhodném dni (tedy po prvním dni kalendářního čtvrtletí).

Podle ustanovení § 101h odst. 2 zákona o DPH, může správce daně uložit pokutu do výše 50 000 Kč plátci, který na základě výzvy správce daně k odstranění pochybností nezmění nebo nedoplní nesprávné nebo neúplné údaje prostřednictvím následného kontrolního hlášení a podle ustanovení § 101h odst. 3 zákona o DPH, správce daně může uložit plátci, který nesplněním povinnosti související s kontrolním hlášením závažně ztěžuje nebo maří správu DPH, pokutu až do výše 500 000 Kč. V těchto případech nesmí být pokuta stanovena v hrubém nepoměru k významu porušené povinnosti a k závažnosti následku pro správu DPH a dále správce daně musí přihlédnout zejména k míře součinnosti ze strany plátce DPH.

Podle dokumentu Informace o činnosti Finanční správy ČR za rok 2023 byly uloženy tisíce pokut souvisejících s kontrolním hlášením. Konkrétně byly uloženy jednotlivé pokuty v těchto ...